Myndighetene forsøkte å pågripe den yngre Guzmán, kjent som «El Raton» (musa), også i 2019.
Den gang reagerte Sinaloa-kartellet, som hans far hadde ledet, voldsomt.
Flere mennesker ble drept da væpnede gjengmedlemmer gikk massivt til angrep med maskingevær.
Myndighetene ble tvunget til å stenge skoler og flyplasser i Culiacán, og Guzmán ble til slutt løslatt på ordre fra president Andrés Manuel López Obrador for å få slutt på voldsbruken.
Hundrevis av påtente biler
Sinaloa-guvernør Ruben Rocha sier at sju personer fra sikkerhetsstyrkene er drept i uroen til nå, og at ytterligere 21 er såret. I tillegg er åtte sivile såret.
Ifølge Rocha har det vært tolv forskjellige sammenstøt mellom sikkerhetsstyrker og gjengmedlemmer, og 250 kjøretøyer er satt i brann og brukt til å sperre veier.
På ikke-verifiserte videoer i sosiale medier kan man se tunge sammenstøt i Culiacán, og skyting fra helikoptre i luften.
Det er blitt løsnet skudd mot et passasjerfly og et fra det mexicanske flyvåpenet. Flyplassene i Culiacán, samt de andre Sinaloa-byene Mazatlán og Los Mochis, er stengt inntil ting roer seg ned.
Det samme gjelder for flere skoler, lokale myndighetsbygg og for mye av næringslivet i Culiacán.
Saken fortsetter under videoen
Kommer før Biden-besøk
López Obrador har raljert mot hans forgjengers aggressive forsøk på å fengsle topper fra landets kartell, men administrasjonen hans ser ut til å ha lyktes denne gangen.
32-åringen sitter i varetekt i hovedstaden Mexico City, ifølge forsvarsminister Luis Cresencio Sandoval.
Pågripelsen skjer like før et møte mellom nordamerikanske ledere i Mexico City til uka og omtales som en seier for Lopez Obrador. Sikkerhet ventes å bli et viktig tema på møtet, der USAs president Joe Biden stiller.
Guzmán anklages for å ha hjulpet faren med å drive narkovirksomheten siden El Chapo ble utlevert til USA i 2017.
Han ble tiltalt for narkotikasmugling av USA i 2018, og ifølge Mexicos utenriksminister Marcelo Ebrard ble han begjært utlevert i 2019.
Ebrard sier at begjæringen både må oppdateres og behandles, men legger til at Guzmán først må stille i en sak i Mexico. El Chapo soner livstid i et høysikkerhetsfengsel i Colorado, et såkalt «supermax».
[ – Dette vil være et enormt slag mot Trump ]
Press på regjeringen
Sinaloa-kartellet er blant verdens mektigste kriminelle gjenger.
En skarp økning i overdosedødsfall i USA, drevet fram av opioidet fentanyl, har ført til økt press på Mexico for å få bukt med gjengkriminaliteten.
Amerikanerne hadde utlovet dusør på 5 millioner dollar for informasjon som kunne føre til at Ovidio Guzmán ble tatt.
Over 340.000 mennesker er drept i Mexico siden regjeringen i 2006 satte inn hæren for å bekjempe de mektige narkotikakartellene i landet.
[ To år siden stormingen av Kongressen – nå lammes den innenfra ]
Hold deg oppdatert. Få daglig nyhetsbrev fra Dagsavisen
[ Heidi Nordby Lunde: En forbanna myte at det alltid lønner seg å jobbe ]