De Minaur sliter med en hofteskade og må derfor gi opp den prestisjetunge gressturneringen.
– Jeg er knust over å måtte trekke meg, sier australieren.
Det betyr at Djokovic får plass i semifinalen, der motstanderen blir vinneren mellom italienske Lorenzo Musetti og amerikanske Taylor Fritz.
Djokovic har vunnet Wimbledon-turneringen sju ganger tidligere.
På den andre siden av tablået møtes Daniil Medvedev og regjerende Wimbledon-vinner Carlos Alcaraz i semifinalen.
Les også: Alcaraz snudde til seier – møter Medvedev i semifinalen i Wimbledon