Angrepet skjedde inne i en moské i Tulkarm, som ligger på den okkuperte Vestbredden.
– Etter skuddutvekslinger drepte israelske styrker fem terrorister som gjemte seg inne i en moské, sier IDF i en uttalelse ifølge nyhetsbyrået AFP.
En av de drepte var ifølge det israelske forsvaret en nøkkelperson i den militante palestinske gruppen Islamsk hellig krig (Jihad) i Nur Shams-flyktningleiren.
Drapet på Muhammad Jabber, også kjent som Abu Shujaa, bekreftes av gruppen selv.
– Abu Shujaa, lederen av Tulkarm-avdelingen i Al-Quds-brigaden, døde sammen med flere brødre i en heltemodig kamp mot israelske soldater, skriver Islamsk hellig krig i en uttalelse.
Gruppen har en sterk tilstedeværelse i flyktningleirene nord på Vestbredden.
Meldingen om de drepte i moskeen kom omtrent et døgn etter at minst ni personer ble drept i israelske angrep i Tulkarm og Jenin, ifølge palestinske helsemyndigheter.
Natt til onsdag fortalte en talsperson for IDF at Israel hadde iverksatt en militæraksjon i området for å forhindre terror.
Les også: – Risikoen for åpen krig er ekte