Det melder FFK. Spillerne fikk beskjed om avgangen mandag formiddag.
Thomassen ledet klubben i 44 seriekamper og sju NM-oppgjør.
– Det er med en svær grad av takknemlighet og ydmykhet at jeg nå går fra å være FFK-trener til å bli FFK-supporter. Jeg har fått gleden av å være med på en del av denne flotte klubbens reise, og har nytt hvert sekund sammen med dere alle, sier Thomassen i en uttalelse.
AIK i Sverige skal være klubben Thomassen har sagt ja til. Det skriver Expressen, Aftonbladet og Nettavisen. Laget har vært på trenerjakt etter at Henning Berg sluttet tidligere i sommer.
FFK hentet inn Thomassen i november 2022. Mannen fra Færøyene fikk skikk på klubben og ledet den i fjor opp til Eliteserien som vinner av 1. divisjon.
Med det var FFK tilbake på øverste nivå siden 2012. Laget har overrasket i comebacket og ligger på en sterk 5.-plass med 23 poeng fra 14 kamper.
– Mikkjal har levert på en stor bestilling og vært en sentral bidragsyter til den gode utviklingen FFK har hatt de siste årene, sier Fredrikstads sportssjef Joacim Heier.
Framover tar assistenttrener Andreas Hagen over som midlertidig hovedtrener.
– Prosessen med å ansette den neste permanente hovedtreneren i FFK starter med en gang, og som ved forrige ansettelse skal det gjøres grundig, tålmodig og med klubbens planverk og strategi som grunnlag, sier Heier.
Les også: Molde forspilte seierssjansen mot FFK: – Vi kan ikke tenke på Bodø