Den 181 kilometer lange etappen fra Ras al Khaimah til Jebel Jais hadde en tøff avslutning, og der kom Pogacars egenskaper til sin rett.
Slovenerens lagkamerater satte opp høy fart i front av feltet opp den siste stigningen og la grunnlaget for at lagkapteinen kunne angripe med under én kilometer til mål.
– På en normal dag skal Pogacar være i en liga for seg selv her, sa Eurosport-kommentator Andreas Staune Mittet før spurten gikk.
Da sloveneren tråkket til, besto frontfeltet av kun et fåtall ryttere. Ingen av dem var i nærheten av å kunne henge på Pogacar.
26-åringen vant foran britiske Oscar Onley og østerrikske Felix Gall.
Torstein Træen er eneste norske deltaker i UAE Tour. Han plasserte seg ikke blant de ti beste onsdag.
Med seieren overtok Pogacar ledelsen i rittet sammenlagt. Han har 18 sekunders forsprang til britiske Josh Tarling.
Les også: Pogacar avsluttet eventyrlig sesong med ny monument-seier: – Ser fram til en ferie
