Landslagslege Rickard Noberius bekrefter frafallet overfor Expressen.
– Vi tar det sikre for det usikre, sier han.
Hagström mislyktes på lørdagens sprint da hun falt og røk ut i kvartfinalen. 26-åringen står med én sprintseier i verdenscupen denne sesongen og er en gullkandidat i VM i Trondheim i februar og mars.
Også tyske Sofie Krehl hopper av Touren, opplyser arrangøren.
Les også: Johaug må jage Diggins - dette er søndagens direktesendte TV-sport
