Dermed er Fulham helt i rygg på torsdagens motstander, som for 10. gang på rad måtte reise hjem fra kamp i London uten seier.
Iwobi scoret et tidlig ledermål etter en fæl miss av Brighton-keeper Bart Verbruggen. Carlos Baleba utlignet i det 56. minutt, men et selvmål av Matt O'Riley på hjørnespark ga Fulham ledelsen igjen i det 79. minutt.
Iwobi fastsatte resultatet tre minutter før full tid.
Sander Berge spilte som vanlig på Fulhams sentrale midtbane. Han pådro seg et gult kort i kampen og ble byttet ut rett før slutt.
Les også: Gedigen keepertabbe ødela Salahs snuoperasjon: – Blandede følelser