Bolsonaros stabssjef sier på sin side at presidenten vil overføre makten til venstreorienterte Lula da Silva.
Presidenten oppfordret imidlertid til ikkevoldelige demonstrasjoner.
– Våre metoder for å demonstrere kan ikke være som de på venstresiden, sa Bolsonaro til pressen tirsdag.
Dette er første gang Bolsonaro uttaler seg etter valgnederlaget. Den sittende presidenten tapte valget med knapp margin mot Lula.
Bolsonaro har vært stille siden valgresultatet ble kjent, og tilbrakte mandagen i presidentpalasset uten å vise seg offentlig. Før valget kom presidenten gjentatte ganger med udokumenterte påstander om at valgsystemet i Brasil er preget av juks.
I etterkant har enkelte av Bolsonaros tilhengere sperret hundrevis av veier med lastebiler, som en protest mot valgresultatet.
Brasils beordret tirsdag trafikkpolitiet til å fjerne lastebilene og sjåførene fra veiene.
