Mannens pårørende er varslet.
Hovedredningssentralen Nord-Norge mottok nødsignal fra et fiskefartøy klokken 1.45 natt til fredag, opplyser redningsleder Tommy Pedersen til NTB.
Det dreide seg om et mindre fiskefartøy med én person om bord.
– Vi oppnådde ikke kontakt med fartøyet, og det ble iverksatt redningsaksjon, sier han.
Både frivillige fartøy, redningsskøyte og redningshelikopter deltok i søket. Det ble funnet en tom redningsflåte, og klokken 3.50 ble mannen funnet omkommet i vannet.
Det er ingenting som tyder på at flere personer var involvert i ulykken, opplyser politiet i Finnmark, som har opprettet sak.